はじまりの木に文明の利器を供物とすることで魔法を使う一族の長である魔法使いの姫君・鎖部 葉風は、はじまりの木に対する意見の対立から姫を補佐すべき鎖部左門によって、魔法を使えない絶海の孤島に放逐された。
数か月後、姫の遺体は白骨化した状態で左門らにより回収され、左門ははじまりの木の復活を阻止すべく、一族を挙げての活動を開始する。