2012年、フリーダイバーの波留真理は、建設中の人工島沖合で観測実験の最中、「海が燃える」現象に遭遇し、49年間も昏睡状態に陥った。
2061年、長い眠りから覚醒した波留は81歳の老人となり、車椅子生活を送らざるを得なくなった。
そんな中、波留は旧友・久島永一郎によって、メタリアル・ネットワーク（通称：メタル）の情報を調査する、電理研外部委託調査員に任命される。
メタルは、安全で人々の欲望を満たす一方、現実世界（リアル）の世界に歪みが生じたからだ。
こうして、波留は蒼井ミナモとバディ（英語で『相棒』の意）を組み、メタルとリアルの間で起きる事件や謎を追うことになる。