森谷りりかは、私立白鳩学園に通うどこにでもいる普通の小学4年生の女の子。
10歳の誕生日に同学園に転校してきた、別の宇宙にあるもう一つの地球・クイーン＝アースの戦士カノン（加納望）から「ナースエンジェル」として地球侵略を企むダークジョーカーと戦い、地球を救う「命の花」を探す使命を託される。
カノンの助けを得ながらダークジョーカーと戦っていくりりかだが、カノンは病気や死を撒き散らす黒のワクチンにその身を蝕まれていた。
ナースエンジェルの聖なる力の源で残り少ない緑のワクチンを惜しむカノンは治療を拒否し、命を落としてしまう。