時は西暦2205年。
歴史改修を目論む“歴史修正主義者"による、過去への攻撃がはじまった。
歴史を守る使命を与えられた“審神者(さにわ)"によって励起された最強の付喪神“刀剣男士"。
これは、そんな彼らが“とある本丸"を舞台に、ひたむきに、そしてほがらかに生きる“花丸"な日々の物語。