夏目 貴志は幼くして母と、続いて父と死別し、幼少期から父方の親戚をたらい回しにされてきた。
貴志には普通の人には見えるはずのない妖怪（妖　あやかし）が見えてしまいそのためにトラブルに巻き込まれることが多かった。
そうした事情により貴志は「虚言癖のある薄気味悪い子供」としてイジメられ、忌み嫌われてきた。
葬儀の席で貴志の置かれた不遇な境遇をみかねた藤原 滋は妻の塔子と相談の上で貴志を自宅に引き取ることにする。
子供もなく夫婦二人きりの藤原夫妻は貴志を実の子のように大切にする。
貴志はようやく落ち着いた暮らしを送れるようになり、高校に北本、西村といった友人たちも出来た。
そんなある日、貴志は妖怪たちに襲われ逃げ回る際に祠に封じられた妖怪斑の封印を解いてしまう。
貴志を見た斑は「夏目レイコじゃないか?」と尋ねる。
レイコは貴志の母方の祖母だった。
藤原宅に戻った貴志はレイコの数少ない遺品の中から「友人帳」を見つける。
友人帳は貴志と同様に妖が見え、天涯孤独だったレイコが妖怪たちをいじめ負かした結果、奪った名を集めた契約書の束だった。
やがて、友人帳は「多くの妖を従え、使役出来る宝物」として妖たちの間に噂として広まっていた。
斑は貴志から友人帳を奪おうとするが、貴志は斑と「俺が死んだら友人帳はお前にやる」という約束をし、かわりに斑は貴志の用心棒となる。
依り代である招き猫と強く結びついてしまった斑は普通の人間には「頭の大きな猫」に見えるためニャンコ先生と呼ばれるようになる。
こうして、貴志とニャンコ先生は友人帳から名を取り戻そうとする者、友人帳を奪おうとする者、希有な存在である貴志を喰らおうとする者、夏目レイコの復活を知って訪ねてきた者、相談事を抱えてきた者など様々な妖怪たちと関わりを持つことになるのだった。
友人帳から名前を返すたびに貴志の脳裏にはレイコの記憶が流れ込む。
レイコと妖怪たちとの繋がりは力任せな主従関係といった単純なものではなく、人から避けられ、人を避けて生きたレイコとそんなレイコを見かねた妖怪たちとの想い出の数々でもあった。
貴志はレイコとの唯一の繋がりであり、名を縛られた妖たちにとっては命も同然の友人帳を大切に扱うようになる。
また、様々な出来事を通じて妖たちとの出会いと別れを繰り返し、彼らを抱えた事情や想いを知ってゆくのだった。