青森の核燃料再処理施設で、二人の人物によってある物体が強奪される。
強奪犯の一人は、施設の床にスプレーで「VON」という謎のメッセージを書き残し、もう一人とともに施設を脱出する。
後に捜査関係者に対して強奪された物体は「プルトニウム」と伝達される。
それから半年後。
夏休み前の暑い日、九重新と久見冬二がとある高校に転入してくる。
周りの注目に目もくれず、二人はある計画を進めようとしていた。
そして、二人は転入先で他の女子生徒からいじめられていた三島リサを気にかける。
リサは二人が幼少期に脱出した施設に残してきた幼馴染に似ていた。