1000年前に現れた破壊の化身「閻禍」（えんか）は、「1000年後に自分の<<子供>>が世界に絶望をもたらす」という不吉な言葉を残し滅びていった。
それから1000年後、DNA鑑定の結果「閻禍の子供」の可能性のある人間・生物が複数発見された。
そのどれが「閻禍の子供」であるかを確かめるため、ある作戦が決行されることになった。
それは、「閻禍の子供」の可能性のある者を家族として共同生活させ、どれが子供かを確かめるという通称「なごやか家族作戦」。
対策局対策一課行動部隊長である乱崎凰火は、この任務を遂行するため「父親」として強制参加させられる。
家族生活の中で、さまざまな（主に家族によって発生する）問題が襲い掛かるが、家族は力を合わせて乗り越えてゆく。