凶悪犯罪に対抗するため、武力を行使する探偵「武偵」の存在が当たり前の社会。
2009年、武偵を育成する東京武偵高校に通う青年・遠山キンジは、普通の生活を求めていた。
しかし、ある日現れたSランク少女武偵である神崎・H・アリアと出会ったことにより、彼女を取り巻く戦いの日々に身を投じていくことになる。