2117年。
未来東京。
7代目小林少年率いる少年探偵団は、7代目明智小五郎とともに、スリリングな冒険とアクションを日常との合間に適度にはさみつつ、ユルユル過ごしていた。
しかしそこには、ある一人の人物「怪人二十面相」の恐るべき企みが潜んでいたのである……。