西暦2058年（玩具CMナレーションでは西暦2050年）。
地球から遙か四十数光年。
イプザーロン系宇宙にある人類の植民惑星クレアドが、異星人の軍隊に突如攻撃され壊滅状態となった。
衛星軌道上の宇宙ステーションへ生き残った難民と軍人が逃れるも追撃を受け続け、練習宇宙艦ジェイナスで隣接の植民惑星ベルウィックへ逃れ潜伏。
その間にも次第に生存者が減り、現地の軍事基地も壊滅。
再度宇宙へ脱出する頃には、大人が一人になっていた。
子供たちは異星人脱獄者との遭遇で得た情報から、異星人側の軍の捕虜となった家族を救出するため、ジェイナス及び人型兵器ラウンドバーニアンで異星人の軍隊と戦いながら、敵軍の基地衛星及び母星を目指す。
しかし、ついに最後の大人も交戦中に撃墜され行方不明となる。
13人の少年少女の旅路は、徐々に熾烈をきわめてゆく。